• Red de Servicios de Laboratorio
  • Otro
  • Tecnologías
Área Temática: Material de siembra y mejoramiento genético

 Servicio de genotipado a gran escala con chips de array para especies animales y vegetales

Descripción

El servicio de genotipado a gran escala con chips de array permite la detección e identificación de miles de regiones tipo SNP (polimorfismos de nucleótido simple) asociadas con características de interés que pueden ser aplicadas a:

• Estimación de los valores genómicos para características de crecimiento, reproducción, conformación y tipo.
• Identificación de los rasgos cuantitativos.
• Evaluación del mérito genético.
• Mapeo genético.
• Estudios de desequilibrio de ligamiento.
• Estudios genéticos comparativos.
• Control de filiación para asignación de paternidad y evaluación de la pureza racial.
• Evaluación de la estructura poblacional y diversidad genética.
• Asociación con enfermedades (identificación de mutaciones genéticas no deseables).

El servicio se aplica en la evaluación de especies animales (bovinos, ovinos, porcinos, caprinos, equinos, entre otros) y especies vegetales (avena, papa, tomate, arveja, entre otras). La especie solicitada por el cliente será consultada a la empresa Illumina o Geneseek, con el fin de evaluar la disponibilidad de los chips; de no estar disponible, se evaluará la posibilidad de customizar los chips para la especie de interés (tiempo de >5 días).

Este análisis se realiza a partir de muestras de ADN provenientes de tejido animal (sangre, semen, músculo o pelo) y tejido vegetal (semilla, hoja, raíz y fruto) que remitan los productores o las personas interesadas al laboratorio de genética molecular de AGROSAVIA - C.I. Tibaitatá.
El servicio incluye la evaluación del ADN por medio de métodos de espectrofotometría, la dilución del material genético, el proceso de genotipado y la lectura de los chips en el equipo secuenciador HiScan SQ de la marca Illumina (único en el país). Los resultados se entregan en un archivo digital en formato Final Report, obtenido del software Genome Estudio, lo cual incluye la edición y limpieza de los genotipos a nivel poblacional.

La prestación de servicios al público en general se puede solicitar a través de la página de AGROSAVIA (www.agrosavia.co), vía correo electrónico: atencionalcliente@agrosavia.co, por medio de la línea telefónica (1) 4227300 Ext. 1369 o directamente en las instalaciones de cualquier centro de investigación de la Corporación.
Mediante la prestación de servicios internos para la agenda de investigación de AGROSAVIA, como apoyo y soporte a la agenda de investigación del SNIA (Sistema Nacional de Innovación Agropecuaria).

Equipo de Investigación Corpoica

  • Yolanda Gómez Vargas
  • Rodrigo Alfredo Martínez Sarmiento
  • Diego Hernán Bejarano Garavito

Cobertura geográfica

Departamentos:

Amazonas,Antioquia,Arauca,Atlántico,Bolívar,Boyacá,Caldas,Caquetá,Casanare,Cauca,Cesar,Chocó,Córdoba,Cundinamarca,Guainía,Guaviare,Huila,La Guajira,Magdalena,Meta,Nariño,Norte de Santander,Putumayo,Quindío,Risaralda,San Andrés y Providencia,Santander,Sucre,Tolima,Valle Del Cauca,Vaupés,Vichada

Municipios:

Todos los municipios del país

Región Natural:

Amazonía,Andina,Caribe,Insular,Orinoquía,Pacífico

Documentación Relacionada

  • R. A. Martínez, R. Dassonneville, D. Bejarano, A. Jimenez, G. Even, G. Mészáros and J. Sölkner. 2016. Direct and maternal genetic effects on growth, reproduction, and ultrasound traits in zebu Brahman cattle in Colombia. Journal of Animal Science. doi:10.2527/jas.2016-0453.
  • Martínez Rodrigo. (1), Bejarano Diego. (1), Gómez Yolanda. (1), Dasoneville Romain. (2), Jiménez Ariel. (3), Even Gael. (2), Sölkner Johann.(4), Mészáros Gabor. 2016. GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY FOR BIRTH, WEANING AND YEARLING WEIGHT IN COLOMBIAN BRAHMAN CATTLE, Genetic Molecular Biology., In press.
  • Martínez Rodrigo, Bejarano Diego, Gómez Yolanda, Polanco Nelson, Ramírez Julián, Fernandez Juan, Dasoneville Romain, Jiménez Ariel, Even Gael, Sölkner Johann, Mészáros Gabor.2016. Genomic Selection for Growth, Reproductive and Conformation Traits in Zebu Brahman in Colombia. Tropentag 2016. in press.
    Plegable: Plataforma de información genómica para uso en selección en la raza Cebu Brahman [Direct and maternal genetic effects on growth, reproduction, and ultrasound traits in zebu Brahman cattle in Colombia. Martínez, R. A., Dassonneville, R., Bejarano, D., Jimenez, A., Even, G., Mészáros, G. & Sölkner, J. 2016.
  • Genome-wide association study for birth, weaning and yearling weight in Colombian Brahman cattle. Martínez, R., Bejarano, D., Gómez, Y., Dasoneville, R., Jiménez, A., Even, G., Sölkner, J., & Mészáros, G. 2016.
  • Genomic Selection for Growth, Reproductive and Conformation Traits in Zebu Brahman in Colombia. Martínez, R., Bejarano, D., Gómez, Y., Polanco, N., Ramírez, J., Fernández J., Dasoneville, R., Jiménez, A., Even, G., Sölkner, J. & Mészáros, G. 2016. [Martínez, R. A., Dassonneville, R., Bejarano, D., Jiménez, A., Even, G.,Mészáros, G., & Sölkner, J. (2016). Direct and maternal genetic effects on growth, reproduction, and ultrasound traits in zebu Brahman cattle in Colombia. Journal of Animal Science, 94(7), 2761-2769. doi:10.2527/jas.2016-0453.
  • Martínez, R., Bejarano, D., Gómez, Y., Dasoneville, R., Jiménez, A., Even, G., … Mészáros, G. (2016). Genome-wide association study for birth, weaning and yearling weight in Colombian Brahman cattle. Genetic Molecular Biology, 40(2), 453-459. doi: 10.1590/1678-4685-GMB-2016-0017.
  • Martínez, R., Bejarano, D., Gómez, Y., Polanco, N., Ramírez, J., Fernández, J., … Mészáros G. (2016). Genomic Selection for Growth, Reproductive and Conformation Traits in Zebu Brahman in Colombia (In press). Tropentag, 
  • Martínez, R. A., Dassonneville, R., Bejarano, D., Jimenez, A., Even, G., Mészáros, G. & Sölkner, J. (2016). Plataforma de información genómica para uso en selección en la raza Cebu Brahman [Direct and maternal genetic effects on growth, reproduction, and ultrasound traits in zebu Brahman cattle in Colombia
  • Martínez, R., Bejarano, D., Gómez, Y., Dasoneville, R., Jiménez, A., Even, G., … Mészáros, G. (2016). Genome-wide association study for birth, weaning and yearling weight in Colombian Brahman cattle. Genetic Molecular Biology, 40(2), 453-459. doi: 10.1590/1678-4685-GMB-2016-0017.
  • Martínez, R., Bejarano, D., Gómez, Y., Polanco, N., Ramírez, J., Fernández J., … Mészáros, G. (2016). Genomic Selection for Growth, Reproductive and Conformation Traits in Zebu Brahman in Colombia. 

Micro sites